Duhanski uređaji zahtijevaju redovito čišćenje. U tu svrhu koriste se jednokratni štapići za čišćenje ili višekratna sredstva za čišćenje ruku. Za bolje rezultate štapiće za čišćenje možete namočiti u sredstva za čišćenje (npr. izopropil alkohol ili polivinil alkohol). Štapići namočeni u odgovarajući alkohol puno su bolji u uklanjanju krhotina s uređaja.
Štapići za čišćenje obično se prodaju u pakiranjima od nekoliko desetaka. Učestalost njihove uporabe ovisi o preporukama proizvođača. Većina komercijalno dostupnih štapića su univerzalni, pa su prikladni za čišćenje grijača raznih proizvođača.
S druge strane, sredstva za čišćenje nisu ništa više od malih četkica kojima se uklanja ostaci zagrijanog duhana. Učestalost čišćenja sredstvom za čišćenje prilagodite količini nakupljene prljavštine. Preporuča se čišćenje barem jednom po pakiranju duhanskih štapića.
Korisni dodatak za korištenje u grijačima duhana su okrugli filteri koji smanjuju stvaranje prljavštine unutar uređaja. Zahvaljujući tome, nije potrebno često čišćenje grijača (nakon svakog zagrijavanja duhana).